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AUTORA: Maria Inés Valderrama Restovic
ORIENTADORA: Luiz Carlos Junior Alcantara
TÍTULO DA TESE: ARTHROPOD BORNE VIRUS database – ABVdb – UM BANCO DE DADOS DE EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR PARA OS VÍRUS DENGUE, ZIKA E CHIKUNGUNYA
PROGRAMA: Pós-Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa
DATA DE DEFESA: 06/09/2018
Resumo
Este trabalho apresenta uma ferramenta de bioinformática que consiste em um banco de dados informações filogenéticas, clínicas e epidemiológicas para os vírus dengue, zika e chikungunya. O banco de dados foi integrado com ferramentas subtipagem virais, que permitem a identificação rápida dos genótipos de novas sequências dos vírus dengue, zika e chikungunya, apoiadas em uma análise filogenética com um forte suporte estatístico. Técnicas de mineração de texto, foram utilizadas nas publicações científicas para extrair, compilar e padronizar informações clínicas e epidemiológicas, que foram acrescentadas ao banco de dados, além disso, as publicações também foram mineradas para completar o possível de dados faltantes das sequências virais. A ferramenta e suas informações são de domínio público, disponibilizando o banco de dados para consulta e recuperação em uma aplicação web totalmente responsiva. Esta aplicação fornece dois tipos de interfase, ambas dinâmicas: um formulário de busca interativo onde usuário realiza suas próprias consultas e as interfases georreferenciadas, criadas através da mineração dos dados contidos no banco, com o objetivo de apresentar as informações preprocessadas e disponibiliza-las visualmente em mapas, onde é possível realizar recuperação dos dados selecionados por regiões geográficas especificas.
