Dissertação faz análise de transcriptoma imune de indivíduos com arbovírus

Getting your Trinity Audio player ready...

Estudante: Joyce Karoline da Silva
Orientação: Antônio Ricardo Khouri Cunha
Título da dissertação: Análise global do perfil de transcriptoma imune de indivíduos com infecção por arbovírus (CHIKUNGUNYA, DENGUE, ZIKA)
Programa: Pós-Graduação em Patologia Humana e Experimental
Data de defesa: 09/09/2024
Horário: 09h00
Local: Sala Virtual do Zoom
ID da reunião: 859 8800 9332
Senha: defesa

Resumo

As infecções pelos vírus da Chikungunya (CHIKV), Dengue (DENV) e Zika (ZIKV) têm a apresentação clínica semelhantes, o que dificulta o diagnóstico clínico presuntivo e laboratorial diferencial durante a fase aguda da doença. Entretanto, a evolução clínica e o risco de complicações diferenciam-se sobremaneira entre os arbovírus ao longo da infecção. A febre Chikungunya apresenta morbidade e tendência a produzir quadro crônico de artralgia e artrite. A Dengue pode causar quadros hemorrágicos potencialmente letais. A infecção pelo Zika é associada ao desenvolvimento de lesões neurológicas em crianças e adultos, como a Síndrome Congênita do Zika e a Síndrome de Guillain-Barré. Com isto este projeto busca revelar alvos terapêuticos e biomarcadores para diagnóstico através de assinaturas gênicas, pela de conjunto de genes, rede gênica e genes hubs. Este estudo analisou as respostas imunológicas nas infecções agudas por CHIKV, DENV e ZIKV usando RNA-Seq de células mononucleares de sangue periférico (PBMC) de indivíduos naturalmente infectados. Aprovado pelo Comitê de Ética da Universidade Federal da Bahia, foram coletadas amostras de sangue e urina para confirmação de infecção por RT-qPCR. Foram recrutados 37 indivíduos com CHIKV, 8 com DENV, 14 com ZIKV e 6 controles saudáveis. O RNA das PBMCs foi sequenciado na plataforma NextSeq 500 da Illumina. Foi realizada uma análise de expressão diferencial com ferramentas de bioinformática e definido como genes diferencialmente expressos (DEGs) segundo os critérios de pajustado < 0,05 e fold change ≥ 2 ou ≤ -2. Com isso foi feito o enriquecimento biológico foi realizado e a análise de co-expressão gênica. Os resultados mostraram respostas específicas para cada vírus: CHIKV apresentou proliferação celular regulada por citocinas, DENV mostrou regulação do ciclo celular, e ZIKV destacou sinalização de quimiocinas. Biomarcadores potenciais identificados incluem ARG1 e ANGPTL4 para CHIKV, HIST1H2BJ para DENV e MIR6775 para ZIKV. A co-expressão gênica revelou módulos distintos associados a respostas imunológicas e metabólicas específicas para cada vírus. Todos os arbovírus apresentaram módulos relacionados à tradução de proteínas e atividade ribossomal, com genes centrais específicos para cada infecção. Este estudo fornece uma compreensão detalhada das respostas imunológicas nas infecções por CHIKV, DENV e ZIKV, identificando biomarcadores e alvos terapêuticos potenciais, essenciais para o desenvolvimento de estratégias diagnósticas e terapêuticas.

twitterFacebookmail
[print-me]