Estudante: Priscila Galvão Dória Antunes
Orientação: Clarissa Araújo Gurgel Rocha
Título da dissertação: Perfil da expressão gênica na resistência terapêutica do câncer de cólon e sua relação com microambiente tumoral
Programa: Pós-Graduação em em Patologia Humana e Experimental
Data de defesa: 05/07/2024
Horário: 13h30
Local: Sala Virtual do Zoom
ID da reunião: 864 9776 0186
Senha: defesa

Resumo

Introdução: o câncer colorretal é uma doença heterogênea, no entanto tratada majoritariamente com terapia sistêmica baseada em 5-Fluorouracil em associação com outros quimioterápicos. Uma significativa parcela dos pacientes é diagnosticada com doença metastática, e apresentam sobrevida global mediana de cerca de 37 meses após o início do tratamento. A resistência a medicamentos antineoplásicos está associada à evolução da doença e ao insucesso terapêutico. Sabe-se que o microambiente tumoral tem um papel importante na progressão do câncer, contribuindo para processos que podem estar associados aos mecanismos de resistência terapêutica no câncer de cólon. Objetivo: Avaliar o perfil de expressão gênica e população de células imunes no câncer de cólon, a fim de contribuir para a identificação de potenciais biomarcadores de resistência terapêutica. Métodos: foi realizado um estudo in silico a partir de dados de RNA-seq de amostras extraídas do banco de dados The Cancer Genome Atlas Program (TCGA) e classificadas nos subgrupos moleculares (CMS1, CMS2, CMS3 e CMS4), subdivididas em dois grupos (resistentes a tratamento e não resistentes). Foram utilizados os seguintes algoritmos: i. Limma, para busca de genes diferencialmente expressos; ii. WGCNA para construção de redes de co-expressão; iii. CIBERSORT, para estimar a proporção de células imunes infiltrantes nas amostras e, iv. TIMER, para explorar a relação entre os genes centrais e o conteúdo de células imunes. Resultados: foram encontrados 20 genes diferencialmente expressos, sendo 18 deles relacionados ao grupo de amostras consideradas resistentes a tratamento oncológico inicial e com pior sobrevida global. Macrófagos M0 e M1 e células T CD4 de memória em repouso estavam em maior proporção e mais infiltradas no microambiente tumoral, quanto maior a expressão de alguns dos genes diferencialmente expressos de resistência terapêutica encontrados. Além disso, esses genes correlacionam-se com processos biológicos de diferenciação neuronal, axogênese e transmissão sináptica. Conclusão: O perfil de expressão gênica encontrado neste estudo sugere a presença de genes diferencialmente expressos de membrana sináptica, os quais podem estar envolvidos com vias neuronais que influenciam o microambiente tumoral. Além disso, a presença de macrófagos M0 e M1, bem como células T CD4 de memória em repouso, sugere uma interação potencial que pode desempenhar um papel na resistência terapêutica observada em pacientes com câncer de cólon.

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