A Plataforma de Bioinformática do IGM foi criada em maio de 2012 e presta serviços em bioinformática para auxiliar em pesquisas desenvolvidas no âmbito institucional. Os serviços oferecidos abrangem a criação, manutenção e mineração de bancos de dados biológicos; análises de sequencias de RNA/DNA e proteínas; treinamento de pessoal para utilização dos recursos de bioinformática disponíveis e suporte para o desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática.

Equipe
Luciano Kalabric Silva – Tecnologista
Artur Trancoso Lopo de Queiroz – Pesquisador
Alisson Silva Fonseca – Bolsista PIBITI
Renato Victoriano – – Bolsista PIBITI

Contato:
kalabric@bahia.fiocruz.br
tel: +55-71-3176-2354

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Oferece serviços de leitura e análise de dados de imunofenotipagem, quantificação de citocinas intracelulares e sobrenadantes de cultura, plasma e soro, ensaios de proliferação celular e separação de células (cell sorting). Atualmente, a Plataforma possui três citômetros: o FACSAriaIIu, o FACSArray e o LSRFortessa. O LSRFortessa, recentemente adquirido, viabiliza a melhoria do padrão para citometria de fluxo de alta performance, uma vez que permite a leitura simultânea de 11 cores. A Plataforma conta também com acessórios do FACSAriaIIu compatíveis com o sorting em placas, lâminas e tubos, oferecendo desta maneira o serviço de isolamento/clonagem de populações de células eucarióticas e procarióticas, a partir de suspensões obtidas de fluídos biológicos, cultura de linhagens celulares, órgãos dissociados e outros. Disponibiliza ainda os softwares DIVA, FCAP e Flow Jo para análises dos resultados.

Principais equipamentos disponíveis:

– Citômetro de Fluxo BD FACSAria™ Cell-Sorting System IIu;
– Citômetro de Fluxo BD FACSArray;
– Citômetro de Fluxo BD LSRFortessa.

Equipe 
Msª Liliane Cunha – Servidora Responsável
Dr. Jorge Clarêncio Andrade – Servidor Consultor
Rafaela Gomes Alves – Bolsista

Contato:
liliane@bahia.fiocruz.br
tel: +55 (71) 3176-2303

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A plataforma de sequenciamento oferece suporte ao desenvolvimento de projetos de pesquisa que necessitam da tecnologia de sequenciamento de ácidos nucléicos, prestando serviços de sequenciamento de DNA, análises de fragmentos e de antígeno humano leucocitário (HLA). Contribui na interpretação de resultados e disponibiliza também os seguintes softwares para análises: SeqScape, Sequence Scanner, BiodEdit, Codon Code Aligner, GeneMapper e Peak Scanner. Recentemente, a plataforma recebeu um scanner de altíssima resolução para leitura de microarranjos (HiScan Illumina), cuja acurácia, sensibilidade e rapidez permitem a análise simultânea de milhões de marcadores genéticos simultaneamente. A aplicação primária do equipamento é a genotipagem, pois é capaz de identificar mais de 4 milhões de polimorfismos de um único nucleotídeo (single nucleotide polymorphisms– SNPs). Adicionalmente, o equipamento permite a leitura de microarranjos de expressão gênica e avaliação do padrão de metilação gênica, entre outras técnicas.

Equipamentos disponíveis:

– Sequenciador automático de DNA ABI 3100 Prism, série: 1592-015, Applied Biosystems;

– Sequenciador automático de DNA ABI 3500XL, série: 24343-130, Applied Biosystems;

– Termocicladores GeneAmp PCR Systems 9700, séries: 805S9142723 e 805S9142726, Applied Biosystems.

Equipe
Silvana Sousa da Paz – Servidora responsável
Marilda de Souza Gonçalves – Servidora Consultora
Maíra dos Santos Silva – Bolsista

Contato:
spaz@bahia.fiocruz.br
Tel: 71 3176-2441

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Plataforma de PCR em Tempo Real realiza ensaios qualitativos e quantitativos baseados na captação de fluorescência em tempo real para detecção e/ou estimativa da concentração de ácidos nucléicos na amostra;

Principais equipamentos disponíveis:

– 7500 Real Time PCR System, série 275001606  Applied Biosystems;

– 7500 Real Time PCR System, série 275001606  Applied Biosystems.
 

Equipe
Záira Onofre Nunes – Servidora responsável
Marilda de Souza Gonçalves – Servidora Consultora

Contato:
spaz@bahia.fiocruz.br
Tel: 71 3176-2441

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