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Discente: Pablo Alessandro Barbosa Viana
Orientador: Pablo Ivan Pereira Ramos
Coorientador: Pedro Milet Meirelles
Título da Dissertação: “MINERAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE RESISTOMAS EM METAGENOMAS EM ESCALA GLOBAL”.
Programa: Pós-Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa
Data de defesa: 03/03/2023
Horário: 13h00
Local: Sala do Zoom
ID da reunião: 854 3363 2089
Senha de acesso: 139248
Resumo
INTRODUÇÃO: A descoberta da penicilina iniciou uma nova era na medicina moderna e propiciou o aumento da procura por novos agentes antimicrobianos. Apesar do crescimento expressivo de novos antibióticos, o uso indiscriminado dessas substâncias, tanto no meio médico quanto veterinário, assim como em processos industriais e agrícolas, vem ocasionando um avanço na pressão seletiva aos ecossistemas microbianos, aumentando a disseminação e dispersão de mecanismos de defesa a esses agentes. Visando combater a problemática apresentada, as abordagens genéticas para o estudo e análise de genes de resistência a antimicrobianos (resistomas) vêm crescendo em importância, à medida que aumenta a disponibilidade de dados de sequenciamento, tornando possível associar essas manifestações fenotípicas com os genótipos disponíveis em bancos públicos de dados biológicos. OBJETIVOS: Este estudo teve por objetivo identificar e caracterizar a abundância e diversidade de genes de resistência a agentes antimicrobianos encontrados em metagenomas distribuídos em escala global em variados tipos de habitats. METODOLOGIA: Realizamos a caracterização dos resistomas de uma base de dados metagenômicos curados (N=7.006 amostras), criada a partir de repositórios públicos representando diversos tipos de ambientes com amostras espalhadas por todo globo. RESULTADOS: Para acelerar e viabilizar as análises em larga-escala destes metagenomas, foi desenvolvido um software para paralelizar essas tarefas na plataforma de computação em nuvem Microsoft Azure. Dos resultados obtidos
identificamos que a correlação do ambiente das amostras, riqueza de gêneros da comunidade microbiana e abundância de transposons, são as principais variáveis ecológicas explicativas dos padrões de distribuição de abundância e riqueza de ARGs. CONCLUSÃO: Estes achados indicam os principais motores de disseminação de ARG e podem ser utilizados para direcionar pesquisas exploratórias para novos agentes antimicrobianos e estudos de análise e dispersão de novas resistências, além de dar ênfase aos maiores risco para direcionar a atenção no combate a esta grande ameaça.
Palavras-chave: Genes de resistência antimicrobiana. Resistoma. Metagenômica. Mineração genômica. Computação em nuvem.
